LncRNA-长链非编码RNA（Long noncoding RNA）是一类长度超过200nt的RNA分子，它们极少具有蛋白编码潜能，并且能够和DNA、RNA及蛋白质结合，以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。LncRNA基因组分析是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有LncRNA和mRNA。

技术优势

1. 采用隶科基因独有的BioinfoSct^TM生物信息技术分析数据
2. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠
3. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为客户提供个性化的生物信息分析服务
4. 技术专家经验丰富，可以根据客户要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果

技术应用

玉米全基因组LncRNAs鉴定

LncRNAs是一类长度超过200nt的RNA分子，植物中的LncRNAs功能很少被报道。玉米LncRNAs的数量、特性和表达模型都没有被报道。 研究利用玉米全基因组注释和RNA－seq数据，鉴定出了20163个推测的LncRNAs，通过研究13种组织和105个玉米中LncRNAs的表达， 发现LncRNAs有很强的组织特异性。

Li L, Eichten S R, Shimizu R, et al. Genome-wide discovery and characterization of maize long non-coding RNAs. Genome biology, 2014, 15(2): R40.

lncRNA在肿瘤形成过程中的调控机制研究

研究对人类结肠癌组织和正常黏膜组织进行RNA测序，两种样本分别得到52M和59M reads。通过比较发现，人类结直肠癌组织中的MYC基因上游515 kb处特异性地转录生成一种长链非编码RNA—CCAT1-L。功能研究表明，抑制CCAT1-L 会降低MYC基因表达；过表达CCAT1-L，会增强MYC基因表达，并促进肿瘤发生。进一步研究发现，编码这种lncRNA的基因座定位在一个超级增强子中，该lncRNA—CCAT1-L通过调节CTCF与染色质的结合来促进MYC基因增强子与启动子远程染色质环的形成。以上研究结果表明，lncRNA在肿瘤形成的过程中充当了一种重要的调控因子。

1. 结直肠癌组织中的MYC基因上游515 kb位点特异性地生成的lncRNA—CCAT1-L。

2. 编码CCAT1-L的基因座定位在一个超级增强子中。

Jian-Feng Xiang, Qing-Fei Yin, Tian ChenHuman et al,. Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus. Cell Research, (2014) :1-19.