Illumina BeadXpress基因分型芯片
产品名称： Illumina BeadXpress基因分型芯片
英文名称： Genotyping using illumina BeadXpress platform
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河北省健海生物芯片技术有限责任公司
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GoldenGate技术流程
1. DNA激活。DNA样本首先要进行激活，以便结合到顺磁颗粒（生物素或链亲和素）上。此激活过程剧烈，DNA需要量很小（250ng, 50ng/μL）。根据多孔级别，每个SNP基因型只需160pgDNA。
2. 杂交。寡核苷酸、杂交缓冲液和顺磁粒子结合到激活的DNA上。每个SNP位点上设计了3种寡核苷酸，对SNP位点上的每个等位基因来说，有两个核苷酸是特异的，叫做ASOs（等位基因特异性寡核苷酸）。第三个寡核苷酸即位点特异性寡核苷酸（LSO），它与SNP位点下游的片段互补。三段寡核苷酸序列包括基因组互补区域和通用PCR引物序列，LSO上还有一段独特的adress，可以与一种特定的微珠结合。采用GoldenGate技术，可以同时将1536个SNP进行整合。寡核苷酸链在引物结合的同时，也与带有顺磁粒子的基因组DNA杂交。杂交之后，进行多次洗脱，去掉多余或未杂交的寡核苷酸，降低噪音。
3. 延伸连接。正确匹配的ASO进而延伸，与LSO延伸的产物连接。
4. 连接产物作为模板，可用通用PCR引物（p1,p2,p3）进行扩增。P1和p2用Cy3- 、 Cy5-标记。
5． 单链下游延伸。
6． 通过特异的adress序列，带有染料标记的DNA与互补的微珠结合。
7． 洗脱，干燥。GoldenGate分析中，与芯片杂交后，液体的样本结合到固体表面上，读出SNP基因型。
8. 用BeadArray Reader读取芯片上的荧光信号，软件依次分析，自动得出基因型。
BeadXpress Reader分析
Illumina 公司的 BeadXpress SNP 基因分型系统是目前世界上通量最高成本最低的顶级基因分型平台，采用微珠芯片技术，可同时对 96 个以上的位点分析，该基因分型系统已经广泛应用于疾病基因多态性研究上。
BeadXpress系统是由BeadXpress Reader和VeraScan软件组成的。BeadXpress Reader适于低通量和高通量的分子研究，采用双色激光检测系统来识别VeraCode微珠上独特的嵌入式全息代码，检测每个微珠上的信号强度。BeadXpress Reader还具有以下特点：应用流体系统和试剂承载器，无需重复添加缓冲液，每天即可扫描多个芯片；开放平台、双色激光检测系统，同时支持单色分析(如ASPE)和双色分析(如illumina的GoldenGate分析)。
