Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)
产品名称: Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)
英文名称: Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)
产品编号: HZ2302
产品价格: 0
产品产地: 中国/上海
品牌商标: 沪震生物
更新时间: 2023-08-17T10:24:20
使用范围: null
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Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)
描述:由于 PCR 对核酸的扩增效率极高,在 PCR 实验中, 非常容易造成移液器、台面、PCR 仪、空气等气溶胶污 染。当实验环境被污染后,会导致阴性样本的假阳性结果。 在该 Probe qPCR Mix 中,将 dNTP 中的 dTTP 全部更换为 dUTP,从而使得扩增后的 PCR 产物中包含 dU 碱基。在 随后的实验中,含有气溶胶污染的 dU PCR 产物,将被本 试剂中的 UNG 糖基化酶降解,从而去除气溶胶的污染效 应,本试剂中的 UNG 酶在 37℃孵育 2 分钟,即可消除高 达 10 万个 Copy 的核酸污染物。 制品中的 Fast Taq DNA 聚合酶采用专有的热启动技 术确保 55℃以下没有任何活性,因此可在室温建立反应 体系。Fast Taq DNA 聚合酶具有卓越的扩增速度,因此满 足快速 PCR 程序,通常在 30min 以内可以完成扩增反应。 同时该聚合酶具有耐受杂质的能力,同样适用于粗制核酸 样本的扩增反应。 5×Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)是一种将热启 动 Fast Taq DNA 聚合酶、UNG 酶、反应 Buffer、dUTP/NTP Mixture 等试剂预混在一起的 5×浓度的单组分预混试剂。 进行实验时,PCR 反应液的配制十分方便简单,只需加 入引物、探针、模板、水即可。该制品不含有 ROX 校正 染料,适用于各种荧光标记探针,并且适用于各种定量 PCR 机型。 包装 规 格 250T 1000T 5×Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG) 1 ml 1 ml×4 储存: (1) 长期保存,请避光置于-20℃或-70℃可保存3年。 (2) 经常使用,融化后可置于 4℃,可保存 1 年。 TaqMan 荧光定量 PCR 试剂盒 操作方法 1、按照如下组分配制 20 μl PCR 反应体系: 终浓度 5×Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG) 4 μl 1× PCR Forward Primer(10 μM) 0.4 μl 0.2 μM PCR Reverse Primer(10 μM) 0.4 μl 0.2 μM Probe (10 μM) 0.2 μl 0.1 μM *DNA 模板 0.5~2 μl ddH2O Up to 20 μl (1)反应体系中引物终浓度为 0.2 μM 即可得到较好的扩增效果。当 反应性能比较差时,可以调整其终浓度 0.1 ~ 1.0 μM。 (2)探针的浓度在 50~250 nM 之间调整;在双探针检测时通常探针 用量减半,扩增引物浓度保持不变。 (3) qPCR 灵敏度极高, 建立反应体系时加入模板量的准确程度对 最终定量结果会有很大的影响。建议将模板稀释后加入反应体系 中,这样可以有效提高实验的重复性,建议 DNA 使用 10-100 ng。 (4) 如模板类型为未稀释 cDNA 原液,使用体积不应超过 qPCR 反 应总体积的 1/10。 2. 进行 Real-Time PCR 反应,通常采用两步法,程序如下: Stage 1: 37℃ 2min(消化污染物) Stage 2: 95℃ 30s Stage 3: 95℃ 5s 60℃ 20s(收集荧光信号)40 cycles 注意:(1)预变性 30s 适合绝大多数扩增反应,如模板结构复杂, 可将预变性时间延长至 3 min。 (2)对于 200 bp 以内的片段,延伸时间最短可设为 10 sec;超过 200 bp 时,推荐延伸时间为 20-30 sec。 3. 反应结束后确认扩增曲线和标准曲线。R Green 探针设计原则 1. 探针位置尽可能地靠近上游引物。 2. 探针长度应在 15-45bp(最好是 20-30bp),以保证结合特 异性。 3. 探针 Tm 值在 65-70℃,通常比引物 TM 值高 5-10℃(至 少要 5℃),GC 含量在 40%-70%。 4. 探针的 5’端应避免使用 G,因为 5G 会有淬灭作用。 5. 整条探针中,C 的含量要明显高于 G 的含量;避免出现 重复的碱基。 6. 为确保引物探针的特异性,最好将设计好的序列 blast 中核实一次,如果发现有非特异性互补区,建议重新设 计引物探针。 7. 尽量避免出现重复的碱基,尤其是 G 碱基,应避免出现 4 个或 4 个以上的 G 重复出现。 常见问题与解决方案 1.扩增曲线异常 (1) 扩增曲线不平滑:模板浓度太低或模板纯度低,换用高 质量模板。 (2) 扩增曲线断裂或下滑:模板浓度较高引起,基线的终点 值大于 CT 值。减小基线终点(CT 值-4),重新分析数据。 (3) 个别扩增曲线突然下降:反应管内留有气泡,配好反 应体系上机前要进行离心,避免管里气泡的出现。 2. 反应结束无扩增曲线 (1)确认程序设置是否正确:是否设置了收集信号步骤,两步 法扩增程序一般设置在退火延伸阶段,三步法设置在 72℃ 延伸阶段。 (2) 模板降解或浓度偏低:如模板降解需重新制备新的模板, 浓度偏低可通过减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品 先从最高浓度做起。 (3) 确认引物是否降解:长时间未用的引物应先通过 PAGE 电泳检测完整性,以排除其降解的可能。 3. CT 值偏大 (1) 扩增效率低:优化反应条件包括引物序列和引物浓度, 或尝试三步法扩增程序。 (2) 模板降解或浓度偏低:如模板降解需重新制备新的模板, 浓度偏低可通过减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品 先从最高浓度做起。 (3) PCR 产物太长:推荐 PCR 产物长度为 100- 200 bp。 (4) 体系中存在 PCR 抑制剂:一般为模板带入,将模板加大 倍数稀释后再进行扩增,或重新制备模板。 4. 阴性对照出现明显扩增 (1) 反应体系污染:用气溶胶去除剂处 理实验台面和环境,更换新的 Mix、水、引物再进行实验。 (2) 引物二聚体的出现:配合融解曲线进行分析。 5. 绝对定量时标准曲线线性关系不佳 (1) 模板浓度太高:提高模板稀释倍数,采用专用稀释液。 (2) 某个标准品降解:重新制备标准品再进行实验。 (3) 加样误差:提高模板稀释倍数后再进行实验。 6. 实验重复性差 (1) 加样体积导致:提高模板稀释倍数,用准确的移液器。 (2)定期校准 qPCR 仪器和移液器。 (3) 模板浓度太低:模板浓度越低,重复性越差,减少模板 稀释度或提高加样体积。
由于PCR对核酸的扩增效率极高,在PCR实验中,非常容易造成移液器、台面、PCR仪、空气等气溶胶污染。当实验环境被污染后,会导致阴性样本的假阳性结果。在该Probe qPCR Mix中,将dNTP中的dTTP全部更换为dUTP,从而使得扩增后的PCR产物中包含dU碱基。在随后的实验中,含有气溶胶污染的dU PCR产物,将被本试剂中的UNG糖基化酶降解,从而去除气溶胶的污染效应,本试剂中的UNG酶在37℃孵育2分钟,即可消除高达10万个Copy的核酸污染物。 5×Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)中的Fast Taq DNA聚合酶采用专有的热启动技术确保55℃以下没有任何活性,因此可在室温建立反应体系。Fast Taq DNA聚合酶具有卓越的扩增速度,因此满足快速PCR程序,通常在30min以内可以完成扩增反应。同时该聚合酶具有耐受杂质的能力,同样适用于粗制核酸样本的扩增反应。 5×Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)是一种将热启动Fast Taq DNA聚合酶、UNG酶、反应Buffer、dUTP/NTP Mixture等试剂预混在一起的5×浓度的单组分预混试剂。进行实验时,PCR反应液的配制十分方便简单,只需加入引物、探针、模板、水即可。该制品不含有ROX校正染料,适用于各种荧光标记探针,并且适用于各种定量PCR机型。 |
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组分 |
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主要特征 |
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应用 |
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DNA和cDNA的相对定量检测。 | ||||||||
注意事项 |
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储存 |
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1. 长期保存,请避光置于-20℃或-70℃可保存3年。 2. 经常使用,融化后可置于4℃,可保存1年。 |
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反应实例 |
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以人MCF7细胞提取的总RNA(1.28 pg-20 ng)为模板进行反转录,反转录后分别取2 μl cDNA产物,应用5xFast DNA Probe qPCR Mix进行qPCR,扩增结果如图A: 扩增曲线;B:测试UNG去除DNA污染的能力。向反应体系中加入含dUTP的PCR产物,分别用普通Fast DNA Probe qPCR Mix(B1)和Fast DNA Probe qPCR Mix(UNG)(B2)进行定量PCR。1-7RNA模板分别为:20 ng、4 ng、0.8 ng、0.16 ng、0.032 ng、6.4 pg和H2O。 | ||||||||
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