实验流程

RAD：限制性酶单酶切+机械打断建库测序，RAD其实就是特异性内切酶两个识别位点之间的一段DNA片段；

GBS（genotyping by sequencing）：常见酶单酶切+PCR选择性扩增短片段序列建库测序；

目前最为常用的简化基因组测序技术主要有RAD和GBS以及其衍生的dd-RAD和2b-RAD。

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样品要求

（1）样品要求

a. 样品类型：DNA 样品、无降解或轻微降解、无污染。

b. 样品需求量：≥1ug；ddRAD-Seq 样品需求量 0.5ug。

c.  样品浓度：≥25 ng/μl；

d.  建议提交样品数量：遗传图谱构建>100；群体进化>30。

（2）注意事项

a. RAD-Seq 对样品定量准确性要求很高，直接影响最终样品间的数据分布。同时多糖、蛋白或高浓度离子也会影响酶切效果，可能导致数据不均。

b. 建议尽可能提供同一批次的基因组 DNA 样品，以免因不同批次提取效果不一而导致酶切效果不均。

c.  务必用 RNase 酶处理基因组 DNA 样品（特别是植物样品），以免影响样品定量的准确性。

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交付结果

基于简化基因组测序可以进行群体进化、全基因组关联分析（GWAS）、遗传图谱及 QTL 定位 等方向的分析，具体的分析方案与报价可讨论后确定。