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第三代基因测序技术

第三代基因测序技术

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产品名称: 第三代基因测序技术

英文名称: Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing

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武汉菲沙基因信息有限公司
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 技术优势

  超长的测序读长:平均测序读长能达到3000至5000碱基,最长的序列能达到20000碱基

  可直接检测碱基修饰

  可直接进行RNA测序

  最小的GC偏向性:在极端高GC和极端低GC区域,可以轻松测定,从而保证序列的均匀覆盖度

  无PCR扩增偏向性:样本不需要进行PCR扩增,避免了覆盖度不均一和PCR artifacts

  尤其适合微生物基因组的研究

研究内容

  基因组、转录组测序和组装

  特定目标区域测定

  碱基修饰检测

技术服务项目

 

技术服务项目


应用说明

 

全基因组De novo测序

      

三代测序以平均15K以上读长,解决了高GC、高重复和海量短序列组装等困扰

 

基因组升级和优化                                                       

三代测序对已完成基因组进行升级,组装效果获得数十倍的提升,能够大幅提高已有基因组的组装指标

 

全长转录组解决方案

 

无需打断、无需组装即可直接读取全长转录组信息,准确辨别二代测序无法识别的同源异构体(isoform)、同源基因、超家族基因或等位基因表达的转录本

 

微生物基因组解决方案

 

三代测序解决了二代测序序列偏短以及无法很好拼接GC异常和高重复区域等诸多问题,能够快速、准确地获得细菌、真菌、病毒、线粒体、叶绿体和BAC基因组完成图

 

表观组

 

PacBio系列在测序中同时检测各种碱基修饰(如5-mC和N6-mA)和DNA损伤,从而揭示表观遗传对控制生长、代谢、分化和癌变相关基因的调控