宏基因组学又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品种提取全部微生物的DNA，构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能

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基因克隆构建与测序；PCR直接测序；常规测序。

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病毒DNA/RNA测序是以病毒核酸为模板，采用PCR或RT-PCR等方法，对全长或部分病毒序列进行核酸测定。对病毒进行测序是快速了解病毒突变、毒力变化、病毒型的有效方法。对病毒的核酸测序，结果准确可靠

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全基因组范围内查找个体或群体间DNA水平各种类型的变异，进行遗传进化分析；通过单体型预测，进行全基因组关联分析（GWAS）。

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